113系700番台は1974年7月に東海道本線山科と北陸本線近江塩津を結ぶ湖西線開業時に投入された耐寒耐雪装備の車両である。
1980年3月のダイヤ改正では、草津線が電化され、113系2700番台が新製投入された。2700番台は、湖西線の700番台との共通運用が行われた。
113系700番台、2700番台は投入当初高槻電車区に配置されたが、1986年に宮原電車区へ移管された。国鉄分割民営化後に700・2700番台は宮原電車区に104両(6両編成6本、4両編成17本)が配置され、湖西線・草津線のほか東海道本線・山陽本線で運用されていた。700・2700番台は1992年より高速化改造が施工され、5700・7700番台となった。
1994年9月には福知山運転所の800番台クハ111-811ほか4両編成が向日町運転所に転入し、高速化を行わず草津線用で運用された。編成はC11編成となり、塗装は福知山色で運用されたのち湘南色へ変更された。この編成は1999年に下関へ転属してH01編成となり、中間電動車の115系への差し替えを経て両先頭車は2016年に廃車となるまで運用された。
1995年には湖西線・草津線用の4両編成が宮原電車区から向日町運転所に転入した。向日町運転所は1996年に京都総合運転所の本所となり、京都総合運転所の本所は2012年に吹田総合車両所京都支所となった。京都総合運転所の113系は山陰本線(嵯峨野線)のC編成と湖西線・草津線用のL編成で運用が分けられたが、運用の都合でC編成がL編成の運用に入ることがあった。
1997年には湖西線・草津線の運用増加のため福知山の800番台4両編成1本が転入し、高速化改造車5800番台となり、L18編成として運用された。
2008年に網干総合車両所の221系の一部が京都総合運転所へ転属し、嵯峨野線・湖西線で運用を開始した。余剰となった113系は広島運転所への転属や岡山電車区への貸出など、車両の動きが続いた。広島・岡山地区転用車は高速化が順次解除され、京都総合運転所に残存したL編成も2011年までに電気連結器の設置が行われている。
5700番台トップナンバーで構成されるL02編成は、先頭車のクハ111-5701・5751がATS-P未設置のまま2010年1月29日付で廃車となった。中間電動車のモハ113・112-5701はL07編成へ転用され、30N体質改善車のクハ111-7705・7755と組成された。従来のL07編成の電動車モハ113・112-7019は日根野電車区へ転属している。
忍者のゆかりの地を走る草津線の沿線活性化のため、2017年より113系の1編成(吹田総合車両所京都支所L6編成、クハ111-7704ほか4両編成)が忍者ラッピング列車「SHINOBI-TRAIN」となり、2017年2月25日より運転を開始した。
2022年4月1日現在、700番台と2700番台に高速化改造を施工した5700・7700番台による64両(4両編成でC編成20両、L編成44両)が吹田総合車両所京都支所に所属する。そのうち、C08・C10・L03・L07・L09・L15編成はモハ112形に集電装置を2基搭載している。体質改善車で組成された編成も多いが、先頭車両のみもしくは中間車両のみを改造した編成も在籍する。
2019年吹田総合車両所京都支所113系編成表 | |||||
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C編成 | ←永原・柘植 | 京都→ | |||
近キト | 4号車 | 3号車 | 2号車 | 1号車 | |
4両編成 | クハ111 | モハ113 | モハ112 | クハ111 | |
20両 | Tc | M | Mp | Tc | 単色化 |
C5 | 5703 | 5716 | 5716 | 5753 | 2010年 |
C13 | 5715 | 5715 | 5715 | 5765 | 2010年 |
C17 | 5713 | 5713 | 5713 | 5763 | 2012年 |
C08 | 5716 | 5714 | 5714 | 5766 | |
C10 | 5706 | 5756 | 5756 | 5756 | |
※1 C8編成、C10編成のモハ112は2パンタ搭載 |
2019年吹田総合車両所京都支所 | |||||
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L編成 | ←永原・柘植 | 京都→ | |||
近キト | 4号車 | 3号車 | 2号車 | 1号車 | |
4両編成 | クハ111 | モハ113 | モハ112 | クハ111 | |
12両 | Tc | M | Mp | Tc | 単色化 |
L03 | 7708 | 5707 | 5707 | 7758 | 2011年 |
L07 | 7705 | 5701 | 5701 | 7755 | 2015年 |
L09 | 7707 | 5717 | 5717 | 7757 | |
L15 | 7706 | 5719 | 5719 | 7756 | 2013年 |
L05 | 5717 | 5720 | 5720 | 5767 | |
L06 | 7704 | 7704 | 7704 | 7754 | ニンジャ |
L12 | 7701 | 7701 | 7701 | 7751 | |
L14 | 7703 | 7703 | 7703 | 7753 | |
L16 | 7702 | 7702 | 7702 | 7752 | |
L17 | 7709 | 7705 | 7705 | 7759 | |
L10 | 7710 | 7706 | 7706 | 7760 | |
※1 L03・L07・L09・L15編成のモハ112は2パンタ搭載 |